Q1:Cut&Tag与CHIP-seq比较,有什么优势?
样品需求量更少:10万个细胞即可;b.信噪比更高;c.周期更快:CUT&Tag采用高活性的自带部分接头的转座酶,无需超声处理等,大大简化了操作流程,节省了实验时间;d.成本更低。
Q2:CUT&Tag对抗体有什么要求?
抗体是CUT&Tag实验成功的最关键因素,优先选用CHIP-seq级别的候选抗体;CHIP级别抗体>非CHIP级别抗体;文献验证过的抗体>非文献验证过的抗体;如果没有找到目的蛋白的CHIP-seq级抗体,通过IP验证的抗体也可以尝试。
Q3:植物组织能做CUT&Tag吗?和动物样本相比有什么特殊要求?
可以做,而且近年来已有成功应用案例。但应尽量选择幼嫩组织(嫩芽、绿叶等嫩组织),减少细胞壁干扰,提高细胞核提取质量。