LncRNA（long non-coding RNA）即长链非编码RNA，是一类长度大于200nt并且一般不编码蛋白质的RNA分子。近十年来，越来越多的研究证明，其在真核生物尤其是哺乳动物中广泛地存在，并起到重要的生物学作用。
与mRNA相同的是，lncRNA同样由细胞中的RNA聚合酶II转录得到；不同的是，其转录丰度和稳定性都较低，并且大都不具有poly A尾的结构。从功能上看，lncRNA的主要通过顺式和反式两种调节方式，分别作用于靶基因的转录水平、转录后水平、翻译水平及表观水平等，起到调控靶基因的表达水平的作用。在生物体中，lncRNA一般具有较强的组织和细胞特异性，并且在最近的研究中也被发现与物种间差异以及发育有很强的关联性。此外，lncRNA也被发现在癌症、免疫缺陷等众多疾病的致病机制中扮演着重要角色。
环状 RNA（circular RNA，circRNA）长度在 200nt 以上，主要由 pre-mRNA 通过可变剪切加工产生；5’端和 3’端共价结合形成闭合结构，广泛存在于动物和植物中。特殊的环状结构使其能够逃逸 RNA 酶的降解，增强体内稳定性。此外，其具有一定的保守性（低于mRNA）和细胞或组织类型特异性。
测序策略：
产品名称 | 研究对象 | 技术策略 | 应用场景说明 |
普通转录组 | 真核mRNA | ployA富集 | 表达谱、差异表达、功能注释、GO/KEGG富集等 |
lncRNA | lncRNA + mRNA + circRNA | rRNA去除 + 链特异性建库 | lncRNA、mRNA、circRNA表达和差异表达，lncRNA-mRNA调控 |
Small RNA测序 | miRNA (piRNA） | 接头连接 + PAGE切胶纯化 | miRNA鉴定与靶点预测/miRNA表达分析 |
全转录组测序（all RNA） | mRNA+lncRNA+circRNA+miRNA | 每个样品建两个文库，lncRNA文库+sRNA文库 | ceRNA分析、WTS分析 |
原核转录组测序 | 细菌mRNA（包含部分sRNA） | rRNA去除 + 链特异性建库 | 原核生物转录研究 |
