转录组是指特定组织或细胞在某个时间或某个状态下转录出来的所有RNA的总和,主要包括mRNA和⾮编码RNA。信使RNA(mRNA)是一类由DNA的一条链作为模板转录而来的,携带遗传信息,能指导蛋白质合成的一类单链核糖核酸。 通过对PolyA特征序列进行序列捕获和二代测序成为RNA定量的常规手段, 通过转录组测序,能够全面获得物种特定组织或器官的转录本信息,从而进行转录本结构研究、变异研究、基因表达水平研究以及全新转录本发现等研究。
测序策略:
产品名称 | 研究对象 | 技术策略 | 应用场景说明 |
普通转录组 | 真核mRNA | ployA富集 | 表达谱、差异表达、功能注释、GO/KEGG富集等 |
lncRNA | lncRNA + mRNA + circRNA | rRNA去除 + 链特异性建库 | lncRNA、mRNA、circRNA表达和差异表达,lncRNA-mRNA调控 |
Small RNA测序 | miRNA (piRNA) | 接头连接 + PAGE切胶纯化 | miRNA鉴定与靶点预测/miRNA表达分析 |
全转录组测序(all RNA) | mRNA+lncRNA+circRNA+miRNA | 每个样品建两个文库,lncRNA文库+sRNA文库 | ceRNA分析、WTS分析 |
原核转录组测序 | 细菌mRNA(包含部分sRNA) | rRNA去除 + 链特异性建库 | 原核生物转录研究 |
