Small RNA-seq
某物种、组织或细胞在特定状态下所有转录产物的集合包括 mRNA、 lncRNA、 small RNA 等。与mRNA不同， small RNA等非编码 RNA 一般不编码蛋白质。Small RNA 种类丰富，通过特异性地识别结合RNA诱导的沉默复合体(RNA-induced silencing complex，RISC)对目标 mRNA的表达在转录和翻译水平进行抑制，在调节个体发育、细胞增殖分化、肿瘤的发生发展及抗病毒等整个细胞水平的几乎所有事件中起着重要的调控作用，是细胞中高度复杂的 RNA 调控网络中的重要成员。目前广为研究的small RNA主要是micro RNA (miRNA)、short interfering RNA（siRNA）和 PIWI-interacting RNA piRNA），其中miRNA的研究最为深入。
测序策略：
产品名称 | 研究对象 | 技术策略 | 应用场景说明 |
普通转录组 | 真核mRNA | ployA富集 | 表达谱、差异表达、功能注释、GO/KEGG富集等 |
lncRNA | lncRNA + mRNA + circRNA | rRNA去除 + 链特异性建库 | lncRNA、mRNA、circRNA表达和差异表达，lncRNA-mRNA调控 |
Small RNA测序 | miRNA (piRNA） | 接头连接 + PAGE切胶纯化 | miRNA鉴定与靶点预测/miRNA表达分析 |
全转录组测序（all RNA） | mRNA+lncRNA+circRNA+miRNA | 每个样品建两个文库，lncRNA文库+sRNA文库 | ceRNA分析、WTS分析 |
原核转录组测序 | 细菌mRNA（包含部分sRNA） | rRNA去除 + 链特异性建库 | 原核生物转录研究 |
