Q1: 如何处理IP-MS实验中的非特异背景（background）？
常用策略：添加BSA/酵母tRNA阻断剂、严格洗涤（增加次数但不丢特异信号）、设置IgG/mock/珠子-only对照组，低丰度互作还可结合交联（DSP/甲醛）稳定复合物。
Q2: IP-MS可用于血浆/细胞裂解样本？
可以，血液样品（无需去除高丰度蛋白）和细胞系建议用NP-40/Triton温和裂解缓冲液，避免SDS破坏复合物。DIA全扫描对高丰度干扰小，可直接上机，无需分级，数据更真实且平行性好。
Q3: 如何评估IP-MS数据的可信度？
看诱饵富集率、互作CV、背景污染、鉴定率和FDR。高品质数据应满足：特异互作重现性高、背景低、生物学通路一致。
