Q1:开展单细胞ATAC测序,是否必须进行核悬液制备?
需要。单细胞ATAC-seq的核心步骤-转座反应,需要以完整的细胞核为反应底物。转座酶必须进入细胞核,才能对核内开放的染色质区域进行切割并插入测序接头。如果只制备单细胞悬液而未分离细胞核,转座酶无法穿透细胞膜进入细胞核,导致转座反应无法有效发生。
Q2:scATAC-seq可以与scRNA-seq联合分析吗?
可以,scATAC-seq与scRNA-seq联合分析是深入研究基因调控网络的标准策略。