Q1：A/B compartments、TADs和Loops这些名词具体代表什么生物学含义？
1）Compartment（A/B区）：染色体在空间上区分为“开放/活跃”的A区和“关闭/抑制”的B区，对应基因表达的ON/OFF状态；
2）TAD（拓扑关联结构域）：染色质的一个“独立调控单元”，结构域内部的互作频率远高于外部，像一个隔离的“反应室”，便于局部基因的精准调控；
3）Loop（染色质环）：由特定蛋白（动物中如CTCF，Cohesin）介导，将两个线性距离较远的位点拉近，常与增强子-启动子互作相关。
Q2：Hi-C实验需要做生物学重复吗？测序数据量是多少？
建议做2个生物学重复，由于染色构象存在个体或细胞间的差异，重复有助于过滤背景噪音，鉴定出真实的、具有普遍性的空间互作。测序量取决于研究目的和基因组大小，一般来说，为了达到loop级别，数据量需达到基因组大小的300×。
