在多组学大数据时代，构建一个物种专属的多组学数据库是数据查询和深度挖掘的研究趋势，也日益成为科研人员关注的热点。
柑橘：CPBD泛基因组辅助育种数据库
2022年，华中农业大学生物信息团队陈玲玲教授课题组（现工作单位广西大学）和柑橘团队徐强教授课题组在 Molecular Plant (IF=17.1) 发表数据库文章，整合了柑橘属下多个物种的基因组、转录组、变异组和表观组的数据，开发了相关在线工具，为柑橘的理论和育种研究提供了重要平台。
大豆：SoyMD多组学数据库
https://yanglab.hzau.edu.cn/SoyMD/#/
2024年，华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室和广州大学生命科学学院分子遗传学与进化创新中心联合通讯在Nucleic Acids Research (IF=16.7) 发表数据库文章，该研究通过搜集和整合大豆基因组、转录组、变异组、表观遗传和表型组等数据，构建出目前最为系统和全面的大豆多组学数据库SoyMD，为大豆遗传育种研究提供了重要的数据资源和分析平台。
猪：PIGOME多组学数据库
2025年中国农业科学院深圳农业基因组研究所、佛山鲲鹏现代农业研究院唐中林团队在Genomics, Proteomics & Bioinformatics (IF=11.5) 发布了猪的多维组学综合数据库PIGOME，为猪功能基因组研究与分子育种提供了“一站式”分析平台。
犬科动物：iDog 2.0多组学数据库
2025年中国科学院昆明动物研究所研究员张亚平院士团队联合国家生物信息中心正高级工程师赵文明团队在Nucleic Acids Research (IF=16.7) 发布新一版犬科动物综合数据库iDog2.0，实现了犬科动物多维组学数据整合，为国内外家犬研究学者提供了有力支撑。
