Q1：Capture Hi-C、传统Hi-C和4C的区别是什么？
参数 | 传统Hi-C | Capture Hi-C | 4C-seq |
3G基因组测序量 | 600G-1000G | 10G-100G | 5G |
分辨率 | 5kb~10kb | <2kb | <2kb |
覆盖区域 | 全基因组 | 多个（几个-上万个）目标区域 | 1个目标区域 |
适用场景 | 全基因组 Compartment、TAD、loop | 多个目标位点精细loops调控 | 只关注1个目标区域 |
技术原理 | 生物素标记，邻近连接 | 对Hi-C文库进行探针捕获 | 两轮酶切链接，反向PCR |
Q2：Capture Hi-C的目标区域可以是哪些？
可以是启动子、增强子、沉默子、GWAS定位的区域（SNP或SV）、ATAC/CUT-Tag的peak峰、或者整个局部区间。
Q3：Capture Hi‑C可以兼容的样本有哪些？
支持细胞、动物组织、植物组织样本；不支持纯DNA、FFPE、严重降解样本。
