Q1:Meta Hi-C和普通宏基因测序有什么区别?
传统宏基因组测序只能获得混合样本的DNA序列,但无法确定序列来源,也难以将质粒、噬菌体等可移动遗传元件(MGEs)与宿主细菌关联。Meta-Hi-C基于“同细胞DNA互作强、异细胞互作弱”的原理,通过检测DNA物理连接信号,直接将MGEs与宿主关联。
Q2:Meta-Hi-C能否区分亲缘关系很近的菌株?
可以。Meta-Hi-C基于物理互作信号而非序列相似性进行聚类。即使两个菌株的基因组序列高度相似(如同一物种的不同菌株),只要它们来自不同的细胞个体,Hi-C互作信号就能将其区分开。