案例一 病害诱导植物微生物组结构与功能适应的变化
Disease-inducedchangesinplantmicrobiomeassemblyandfunctional
Adaptation
研究材料：中国贵州辣椒微生物群。
研究组学：宏基因组
研究亮点：揭示决定植物相关微生物组组装、共现模式和功能的基本生态模式
主要结果：
本研究综合植物地上和地下生态位，系统地探究了尖孢镰刀菌侵染对辣椒微生物组的影响。研究结果表明生态位是细菌和真菌群落构建的主要驱动因素，其次是FWD和采样地点。与细菌群落相比真菌群落对FWD更为敏感，并且真菌类群在患病植物跨界互作网络中连接度提高。
FWD对果实微生物组的影响小于根和茎。FWD导致辣椒植株富集潜在致病真菌，同时也招募潜在有益细菌。宏基因组差异功能分析进一步揭示了参与甲基受体趋化性蛋白相关的功能基因在患病植物微生物组中的上调，为植物的“cryforhelp”策略提供了间接证据。在玉米田和水稻田土壤中都观察到了类似的结果。
案例二 整合多组学技术将中温大曲中的核心及区域特异性微生物群与风味代谢联系起来
Integrating multi–omics to link core and region-specific microbiota to flavor metabolism in medium-temperature Daqu
研究材料：中温大曲
研究组学：宏基因组+代谢组
研究亮点：通过多组学分析揭示了中温大曲核心微生物群与风味代谢的关联，并通过实验验证了关键菌株的酯类合成功能。
主要结果：
本研究整合宏基因组学与代谢组学，系统解析中温大曲的微生物群落及风味代谢机制。研究发现，不同产区虽存在微生物差异，但 Aspergillus、Rhizopus 和 Bacillus 等核心菌群稳定存在，并富集于碳水化合物、氨基酸及酯类代谢相关通路。多组学关联分析揭示了关键微生物与风味酯类生成的潜在联系，体外实验进一步验证了 Wickerhamomyces anomalus 与 Bacillus velezensis 的酯类合成能力。本研究为大曲功能微生物筛选及风味品质调控提供了理论依据。
